Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P04212 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P04212 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms