Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3542K7N6U2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms