Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rrn3B2RS91 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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