Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac6Q9Z2V5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms