Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdcd6ipQ9WU78 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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