Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Wdr54Q9R0D8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms