Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ccl28Q9JIL2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl28Q9JIL2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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