Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pdzd9Q9D9M4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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