Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PudpQ9D5U5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms