Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pramef12Q9D2F1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pramef12Q9D2F1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms