Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp8Q9CY28 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp8Q9CY28 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp8Q9CY28 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtpbp8Q9CY28 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtpbp8Q9CY28 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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