Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lpin3Q99PI4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lpin3Q99PI4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lpin3Q99PI4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms