Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxc12Q8K5B8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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