Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Znf428Q8C1M2 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Znf428Q8C1M2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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