Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms