Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Zbed4Q80WQ9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbed4Q80WQ9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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