Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dsg1bQ7TSF1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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