Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tmed3Q78IS1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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