Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd3eapQ76KJ5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd3eapQ76KJ5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms