Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b3Q6UQ17 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp8b3Q6UQ17 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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