Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ecm29Q6PDI5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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