Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smchd1Q6P5D8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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