Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Mvb12bQ6KAU4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mvb12bQ6KAU4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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