Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca2Q6DIC0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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