Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprjQ64455 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprjQ64455 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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