Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Utp20Q5XG71 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms