Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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LpoQ5SW46 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LpoQ5SW46 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LpoQ5SW46 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms