Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Znf48Q3US17 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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