Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trafd1Q3UDK1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms