Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q3U6N9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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