Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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