Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Thbs3Q05895 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 608 ms