Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col1a2Q01149 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms