Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms