Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AlkP97793 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AlkP97793 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AlkP97793 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms