Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd13P70217 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hoxd13P70217 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd13P70217 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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