Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc13P50207 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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