Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms