Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms