Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pde6aP27664 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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