Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PdgfraP26618 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PdgfraP26618 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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