Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gja1P23242 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms