Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms