Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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RarbP22605 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RarbP22605 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RarbP22605 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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