Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SftpcP21841 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms