Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18528 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18528 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18528 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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