Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ccl20O89093 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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