Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 356.2 ms