Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ptpn20O55082 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptpn20O55082 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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