Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms